Niksar'da Ticaret ve Sanayi Odasına kayıtlı 504 tüccar bulunmaktadır. Kayıtlı üyelerin 242’sı tüzel kişilik 262’de gerçek kişiliktir.
Faal durumda olan Kooperatif;  5 adet motorlu taşıyıcılar kooperatifi, 3 adet konut yapı kooperatifi, 1 adet tüketim kooperatifi, 7 adet tarımsal kalkınma kooperatifi,1 adet esnaf kefalet kooperatifi ve 1 adet Küçük Sanayi Sitesi Kooperatifi olmak üzere toplam 18 adettir. 2 adet Üretici Birliği bulunmaktadır. 
İlçede 61 adet Anonim şirket, 181 adet limited şirket bulunmaktadır.  
Niksar Küçük Sanayi Sitesi, 03.03.1976 yılında kurulmuş ve 1994 yılında faaliyete geçmiştir. 354 işyeri mevcut olup, bunun 240’ında esnaflarımız faaliyet göstermektedir. Ayrıca Sanayi Sitesi içerisinde Hızarcılar Sitesi oluşturulmuştur. Sitede toplam çalışan kişi sayısı 980’dir. Sanayi Sitesinde 3 adet sosyal tesis ve Mesleki Eğitim Merkezi mevcuttur.
Niksar Organize Sanayi Bölgesi
Niksar Organize Sanayi Bölgesi, Gürçeşme Beldesinde yer tespiti yapılarak 1997 yılında kurulmuş olup, 1. etap 50 hektar alanın altyapı çalışmaları tamamlanmıştır.
Niksar OSB’nin I. etap 50 hektar alandaki 17 adet sanayi parselimizin 11 adedini 10 firmamıza tahsis edilmiştir.